Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad7O35253 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad7O35253 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad7O35253 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smad7O35253 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smad7O35253 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Smad7O35253 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms