Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkd2O35245 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkd2O35245 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms