Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe40O35185 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms