Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ArxO35085 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ArxO35085 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ArxO35085 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ArxO35085 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ArxO35085 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ArxO35085 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ArxO35085 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ArxO35085 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ArxO35085 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ArxO35085 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ArxO35085 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ArxO35085 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ArxO35085 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ArxO35085 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ArxO35085 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ArxO35085 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ArxO35085 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ArxO35085 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ArxO35085 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ArxO35085 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ArxO35085 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ArxO35085 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ArxO35085 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ArxO35085 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ArxO35085 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ArxO35085 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ArxO35085 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ArxO35085 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ArxO35085 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ArxO35085 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ArxO35085 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ArxO35085 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ArxO35085 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ArxO35085 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ArxO35085 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ArxO35085 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ArxO35085 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ArxO35085 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ArxO35085 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ArxO35085 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ArxO35085 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ArxO35085 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ArxO35085 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ArxO35085 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ArxO35085 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ArxO35085 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ArxO35085 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ArxO35085 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ArxO35085 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ArxO35085 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ArxO35085 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ArxO35085 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ArxO35085 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ArxO35085 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ArxO35085 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ArxO35085 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ArxO35085 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ArxO35085 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ArxO35085 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ArxO35085 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ArxO35085 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ArxO35085 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ArxO35085 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ArxO35085 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ArxO35085 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ArxO35085 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ArxO35085 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ArxO35085 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ArxO35085 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ArxO35085 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ArxO35085 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ArxO35085 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ArxO35085 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ArxO35085 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ArxO35085 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ArxO35085 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ArxO35085 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ArxO35085 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ArxO35085 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ArxO35085 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ArxO35085 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ArxO35085 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ArxO35085 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ArxO35085 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ArxO35085 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ArxO35085 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ArxO35085 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ArxO35085 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ArxO35085 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ArxO35085 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ArxO35085 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ArxO35085 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ArxO35085 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ArxO35085 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ArxO35085 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ArxO35085 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ArxO35085 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ArxO35085 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ArxO35085 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms