Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps1O08983 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps1O08983 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps1O08983 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps1O08983 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps1O08983 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps1O08983 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Hps1O08983 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps1O08983 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps1O08983 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps1O08983 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Hps1O08983 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hps1O08983 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps1O08983 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps1O08983 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hps1O08983 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps1O08983 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps1O08983 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps1O08983 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps1O08983 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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