Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NumblO08919 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NumblO08919 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NumblO08919 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NumblO08919 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NumblO08919 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NumblO08919 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NumblO08919 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NumblO08919 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NumblO08919 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NumblO08919 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NumblO08919 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NumblO08919 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NumblO08919 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NumblO08919 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NumblO08919 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NumblO08919 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NumblO08919 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NumblO08919 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NumblO08919 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NumblO08919 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NumblO08919 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NumblO08919 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NumblO08919 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NumblO08919 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NumblO08919 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
NumblO08919 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NumblO08919 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NumblO08919 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NumblO08919 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NumblO08919 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NumblO08919 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NumblO08919 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NumblO08919 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NumblO08919 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NumblO08919 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NumblO08919 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NumblO08919 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NumblO08919 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NumblO08919 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NumblO08919 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NumblO08919 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NumblO08919 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NumblO08919 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NumblO08919 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NumblO08919 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NumblO08919 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NumblO08919 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NumblO08919 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NumblO08919 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NumblO08919 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NumblO08919 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NumblO08919 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NumblO08919 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NumblO08919 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NumblO08919 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NumblO08919 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NumblO08919 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NumblO08919 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NumblO08919 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NumblO08919 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NumblO08919 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NumblO08919 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NumblO08919 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NumblO08919 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NumblO08919 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NumblO08919 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NumblO08919 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NumblO08919 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NumblO08919 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NumblO08919 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NumblO08919 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NumblO08919 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NumblO08919 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NumblO08919 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NumblO08919 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NumblO08919 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NumblO08919 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NumblO08919 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NumblO08919 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NumblO08919 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NumblO08919 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NumblO08919 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NumblO08919 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NumblO08919 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NumblO08919 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NumblO08919 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NumblO08919 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NumblO08919 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NumblO08919 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NumblO08919 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NumblO08919 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NumblO08919 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NumblO08919 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NumblO08919 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NumblO08919 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NumblO08919 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NumblO08919 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NumblO08919 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NumblO08919 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms