Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EllO08856 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EllO08856 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EllO08856 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EllO08856 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EllO08856 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EllO08856 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EllO08856 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EllO08856 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EllO08856 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EllO08856 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EllO08856 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EllO08856 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EllO08856 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EllO08856 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EllO08856 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EllO08856 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EllO08856 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EllO08856 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EllO08856 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EllO08856 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EllO08856 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EllO08856 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EllO08856 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EllO08856 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EllO08856 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EllO08856 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EllO08856 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EllO08856 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EllO08856 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EllO08856 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EllO08856 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EllO08856 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EllO08856 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EllO08856 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EllO08856 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EllO08856 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EllO08856 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EllO08856 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EllO08856 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EllO08856 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EllO08856 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EllO08856 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EllO08856 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EllO08856 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EllO08856 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EllO08856 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EllO08856 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EllO08856 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EllO08856 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EllO08856 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EllO08856 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EllO08856 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EllO08856 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EllO08856 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EllO08856 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EllO08856 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EllO08856 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EllO08856 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EllO08856 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EllO08856 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EllO08856 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EllO08856 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EllO08856 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EllO08856 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EllO08856 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EllO08856 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EllO08856 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EllO08856 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EllO08856 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EllO08856 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EllO08856 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EllO08856 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EllO08856 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EllO08856 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EllO08856 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EllO08856 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EllO08856 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EllO08856 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EllO08856 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EllO08856 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EllO08856 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EllO08856 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EllO08856 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EllO08856 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EllO08856 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EllO08856 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EllO08856 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EllO08856 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EllO08856 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EllO08856 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EllO08856 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EllO08856 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EllO08856 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EllO08856 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EllO08856 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EllO08856 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EllO08856 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EllO08856 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EllO08856 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms