Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckarO08786 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckarO08786 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckarO08786 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckarO08786 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckarO08786 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckarO08786 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckarO08786 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckarO08786 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckarO08786 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CckarO08786 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckarO08786 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckarO08786 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckarO08786 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckarO08786 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckarO08786 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CckarO08786 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckarO08786 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CckarO08786 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckarO08786 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckarO08786 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckarO08786 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckarO08786 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckarO08786 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckarO08786 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckarO08786 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckarO08786 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckarO08786 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckarO08786 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckarO08786 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckarO08786 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckarO08786 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckarO08786 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckarO08786 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckarO08786 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckarO08786 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckarO08786 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckarO08786 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckarO08786 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckarO08786 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckarO08786 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CckarO08786 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CckarO08786 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckarO08786 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckarO08786 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckarO08786 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckarO08786 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CckarO08786 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckarO08786 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckarO08786 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckarO08786 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckarO08786 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckarO08786 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckarO08786 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckarO08786 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckarO08786 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckarO08786 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckarO08786 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckarO08786 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms