Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MttpO08601 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MttpO08601 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MttpO08601 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MttpO08601 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MttpO08601 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MttpO08601 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MttpO08601 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MttpO08601 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MttpO08601 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MttpO08601 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MttpO08601 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MttpO08601 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MttpO08601 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MttpO08601 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MttpO08601 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MttpO08601 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MttpO08601 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MttpO08601 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MttpO08601 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MttpO08601 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MttpO08601 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MttpO08601 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MttpO08601 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MttpO08601 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MttpO08601 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MttpO08601 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MttpO08601 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MttpO08601 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MttpO08601 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MttpO08601 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MttpO08601 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MttpO08601 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MttpO08601 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MttpO08601 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MttpO08601 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MttpO08601 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MttpO08601 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MttpO08601 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MttpO08601 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MttpO08601 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MttpO08601 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MttpO08601 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MttpO08601 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MttpO08601 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MttpO08601 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MttpO08601 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MttpO08601 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MttpO08601 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MttpO08601 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MttpO08601 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MttpO08601 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MttpO08601 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MttpO08601 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MttpO08601 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MttpO08601 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MttpO08601 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MttpO08601 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MttpO08601 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MttpO08601 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MttpO08601 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MttpO08601 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MttpO08601 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MttpO08601 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MttpO08601 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MttpO08601 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MttpO08601 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MttpO08601 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MttpO08601 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MttpO08601 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MttpO08601 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MttpO08601 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MttpO08601 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MttpO08601 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MttpO08601 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MttpO08601 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MttpO08601 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MttpO08601 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MttpO08601 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MttpO08601 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MttpO08601 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MttpO08601 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MttpO08601 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MttpO08601 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MttpO08601 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MttpO08601 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MttpO08601 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MttpO08601 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MttpO08601 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MttpO08601 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MttpO08601 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MttpO08601 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MttpO08601 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MttpO08601 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MttpO08601 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MttpO08601 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MttpO08601 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MttpO08601 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MttpO08601 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MttpO08601 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms