Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna4O08542 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna4O08542 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna4O08542 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna4O08542 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna4O08542 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna4O08542 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna4O08542 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna4O08542 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna4O08542 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna4O08542 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna4O08542 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna4O08542 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna4O08542 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna4O08542 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna4O08542 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna4O08542 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna4O08542 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna4O08542 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna4O08542 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna4O08542 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Efna4O08542 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Efna4O08542 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Efna4O08542 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna4O08542 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna4O08542 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna4O08542 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna4O08542 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna4O08542 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna4O08542 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna4O08542 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna4O08542 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms