Protein–RNA interactions for Protein: M0QWJ9

Tmem178b, Transmembrane protein 178B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem178bM0QWJ9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem178bM0QWJ9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms