Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms