Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Gm20939L7N243 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm20939L7N243 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm20939L7N243 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm20939L7N243 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm20939L7N243 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm20939L7N243 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm20939L7N243 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm20939L7N243 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20939L7N243 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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