Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IfnabL7MTU6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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