Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U0

Vmn1r142, Taste receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r142K7N6U0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r142K7N6U0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r142K7N6U0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r142K7N6U0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms