Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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Gm379J3QQ19 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm379J3QQ19 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm379J3QQ19 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm379J3QQ19 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm379J3QQ19 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm379J3QQ19 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm379J3QQ19 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm379J3QQ19 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm379J3QQ19 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm379J3QQ19 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm379J3QQ19 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm379J3QQ19 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm379J3QQ19 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm379J3QQ19 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm379J3QQ19 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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