Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm8888J3QPX5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm8888J3QPX5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm8888J3QPX5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm8888J3QPX5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm8888J3QPX5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm8888J3QPX5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8888J3QPX5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms