Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccer2J3QPU5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccer2J3QPU5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms