Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5225J3QPL3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms