Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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