Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn34c2J3QNM1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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