Protein–RNA interactions for Protein: J3QNH3

Gm21788, Predicted gene, 21788, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21788J3QNH3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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