Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm20918J3QN17 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm20918J3QN17 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm20918J3QN17 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm20918J3QN17 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm20918J3QN17 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm20918J3QN17 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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