Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Gm3415J3QMS8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Gm3415J3QMS8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Gm3415J3QMS8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Gm3415J3QMS8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Gm3415J3QMS8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Gm3415J3QMS8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Gm3415J3QMS8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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