Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms