Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm20873J3QMQ9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm20873J3QMQ9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm20873J3QMQ9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm20873J3QMQ9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm20873J3QMQ9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm20873J3QMQ9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm20873J3QMQ9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm20873J3QMQ9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm20873J3QMQ9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm20873J3QMQ9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm20873J3QMQ9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gm20873J3QMQ9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20873J3QMQ9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm20873J3QMQ9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm20873J3QMQ9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm20873J3QMQ9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20873J3QMQ9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20873J3QMQ9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20873J3QMQ9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20873J3QMQ9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20873J3QMQ9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20873J3QMQ9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20873J3QMQ9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20873J3QMQ9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20873J3QMQ9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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