Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zfp870J3QMA4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Zfp870J3QMA4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Zfp870J3QMA4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zfp870J3QMA4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Zfp870J3QMA4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Zfp870J3QMA4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Zfp870J3QMA4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp870J3QMA4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp870J3QMA4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp870J3QMA4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms