Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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