Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms