Protein–RNA interactions for Protein: I6L890

Casp16-ps, Caspase 16, apoptosis-related cysteine peptidase, pseudogene, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp16-psI6L890 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp16-psI6L890 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp16-psI6L890 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casp16-psI6L890 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Casp16-psI6L890 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casp16-psI6L890 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casp16-psI6L890 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casp16-psI6L890 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Casp16-psI6L890 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms