Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm29394H3BIW7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm29394H3BIW7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm29394H3BIW7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm29394H3BIW7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm29394H3BIW7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm29394H3BIW7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm29394H3BIW7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm29394H3BIW7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm29394H3BIW7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm29394H3BIW7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm29394H3BIW7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm29394H3BIW7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm29394H3BIW7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm29394H3BIW7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms