Protein–RNA interactions for Protein: G8JL69

Gm11027, Predicted gene 11027, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11027G8JL69 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm11027G8JL69 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm11027G8JL69 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm11027G8JL69 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm11027G8JL69 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11027G8JL69 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms