Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Taf4bG5E8Z2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms