Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn20G5E8X0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn20G5E8X0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms