Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HrcG5E8J6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms