Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms