Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcf11G3X9Z4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcf11G3X9Z4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcf11G3X9Z4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcf11G3X9Z4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcf11G3X9Z4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcf11G3X9Z4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcf11G3X9Z4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcf11G3X9Z4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcf11G3X9Z4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcf11G3X9Z4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcf11G3X9Z4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcf11G3X9Z4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcf11G3X9Z4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcf11G3X9Z4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcf11G3X9Z4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcf11G3X9Z4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcf11G3X9Z4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcf11G3X9Z4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcf11G3X9Z4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcf11G3X9Z4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcf11G3X9Z4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcf11G3X9Z4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pcf11G3X9Z4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcf11G3X9Z4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms