Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnmal2G3X9N3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms