Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms