Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgef1G3X9K3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgef1G3X9K3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms