Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chrna9G3X8Z7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrna9G3X8Z7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms