Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Susd5G3UW60 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Susd5G3UW60 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Susd5G3UW60 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd5G3UW60 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd5G3UW60 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd5G3UW60 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms