Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34aG3UW52 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34aG3UW52 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34aG3UW52 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34aG3UW52 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34aG3UW52 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34aG3UW52 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34aG3UW52 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34aG3UW52 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34aG3UW52 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34aG3UW52 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34aG3UW52 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34aG3UW52 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms