Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ercc6F8VPZ5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ercc6F8VPZ5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms