Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9yF8VPU6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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