Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arid4aF8VPQ2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms