Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5160F8VPN3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms