Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm8444F6XS56 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm8444F6XS56 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm8444F6XS56 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm8444F6XS56 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm8444F6XS56 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm8444F6XS56 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8444F6XS56 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8444F6XS56 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8444F6XS56 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8444F6XS56 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8444F6XS56 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8444F6XS56 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8444F6XS56 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8444F6XS56 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8444F6XS56 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm8444F6XS56 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms