Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Crocc2F6XLV1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms