Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms